1 20 Pierce EZ-Link PEO-Iodoacetyl Biotin 6 56 N-trideuteriumacetoxy 9 60 N-(4-trimethylammoniumbutanoxy)-NHS 13 4 Carboxyamidomethylation 11 6 Carboxymethylation 24 121 glycineglycine 20 108 CysNEM 28 123 Harbury glyco-ICAT C12 29 124 Harbury glyco-ICAT C13 32 126 3,3-Dithio-bis-(sulfosuccinimidyl)propionate 49 135 C14:2 fatty acylation 47 134 C14:1 acylation 48 134 myristoyl with one double bond 50 135 myristoyl with 2 double bonds 52 52 homoarginine 56 140 Decarboxylation of C-terminus as reaction inside the mass spectrometer 57 159 chitobiose core 238 332 Thiophos-biotin disulfide 64 17 Dimethylacrylamide, DMA 66 171 NBS reagent heavy 123 193 Double O18 (C-term) 81 176 Butylated Hydroxytoluene 83 178 b-elimination thiol derivatization 182 184 heavy tyrosine 118 185 heavy phosphotyrosine 96 186 HPG arginine 97 187 2 HPG arginine 184 206 Acrolein56 183 207 Acrolein38 185 208 Acrolein76 187 209 Acrolein112 186 205 Acrolein94, FDP 153 258 H2 18O Alkaline Phosphatase 181 259 heavy lysine 165 261 N-Terminal/lysine sulfonation 173 262 Trideuteration 174 264 b-elimination PET derivatisation 172 94 2-methoxy-4,5-dihydro-1H-imidazole derivative 171 95 2-methoxy-4,5-dihydro-1H-imidazole derivative 233 286 C-Terminal/Glutamate/Aspartate sulfonation 235 285 C-Terminal/Glutamate/Aspartate sulfonation 189 272 CAF 198 292 UV induced cross-link product of Iodo-U-amp with WFY 200 293 3-thiopropanoyl moiety from reduced DSP crosslinker or NHS-SS-biotin, modified with Iodoacetamide 206 295 deoxyhexose 207 296 N-Terminal/arginine sulfonation 208 297 Guanidination followed by N-Terminal/Lysine sulfonation 217 301 mBromobimane 216 302 Vitamin k3 (Q) 225 318 MDA62 224 319 MDA54 227 324 DTBP 253 325 10-fluoroethoxyphosphinyl-N-(biotinamidopentyl)decanamide 251 340 bromotryptophan 252 333 6-N-biotinylaminohexyl isopropyl phosphorofluoridate 1 - 0 0 0 0 0 2 A Ala Alanine 5 3 1 1 0 3 R Arg Arginine 12 6 4 1 0 4 N Asn Asparagine 6 4 2 2 0 5 D Asp Aspartic acid 5 4 1 3 0 6 C Cys Cysteine 5 3 1 1 1 7 E Glu Glutamic acid 7 5 1 3 0 8 Q Gln Glutamine 8 5 2 2 0 9 G Gly Glycine 3 2 1 1 0 10 H His Histidine 7 6 3 1 0 11 I Ile Isoleucine 11 6 1 1 0 12 L Leu Leucine 11 6 1 1 0 13 K Lys Lysine 12 6 2 1 0 14 M Met Methionine 9 5 1 1 1 15 F Phe Phenylalanine 9 9 1 1 0 16 P Pro Proline 7 5 1 1 0 17 S Ser Serine 5 3 1 2 0 18 T Thr Threonine 7 4 1 2 0 19 W Trp Tryptophan 10 11 2 1 0 20 Y Tyr Tyrosine 9 9 1 2 0 21 V Val Valine 9 5 1 1 0 22 N-term N-term N-term 1 0 0 0 0 23 C-term C-term C-term 1 0 0 1 0 1 2 H 1 2 3 C 1 3 4 N 1 4 5 O 1 5 6 P 1 6 7 S 1 7 8 H2 1 8 9 O18 1 9 10 F 1 10 11 Na 1 11 12 Se 1 12 13 H 10 13 13 C 6 14 13 O 5 15 14 C 8 16 14 H 13 17 14 N 1 18 14 O 5 19 15 C 2 20 15 H 2 21 15 O 1 22 16 C 6 23 16 H 10 24 16 O 4 25 17 C 6 26 17 H 8 27 17 O 6 28 18 C 9 29 18 H 14 30 18 O 8 31 19 C 8 32 19 H 12 33 19 O 7 34 20 C 1 35 20 H 2 36 21 C 11 37 21 H 17 38 21 N 1 39 21 O 8 40 22 C 11 41 22 H 17 42 22 N 1 43 22 O 9 44 23 H 2 45 23 O 1 46 24 H 1 47 24 P 1 48 24 O 3 49 25 S 1 50 25 O 3 51 26 C 5 52 26 H 8 53 26 O 4 54 27 Li 1 55 28 C13 1 56 29 N15 1 57 30 Cl 1 58 31 K 1 59 32 Ca 1 60 33 Fe 1 61 34 Ni 1 62 35 Zn 1 63 36 Br 1 64 37 Ag 1 65 38 Hg 1 66 39 Au 1 67 40 I 1 1 - 2 H Hydrogen 3 C Carbon 4 N Nitrogen 5 O Oxygen 6 P Phosphorous 7 S Sulphur 8 H2 Deuterium 9 O18 Oxygen 18 10 F Fluorine 11 Na Sodium 12 Se Selenium 13 Hex Hexose 14 HexNAc N-Acetyl Hexosamine 15 Ac Acetate 16 dHex Deoxy-hexose 17 HexA Hexosamine 18 Kdn 3-deoxy-d-glycero-D-galacto-nonulosonic acid 19 Kdo 2-keto-3-deoxyoctulosonic acid 20 Me Methyl 21 NeuAc N-acetyl neuraminic acid 22 NeuGc N-glycoyl neuraminic acid 23 Water Water 24 Phos Phosphate 25 Sulf Sulfate 26 Pent Pentose 27 Li Lithium 28 C13 Carbon 13 29 N15 Nitrogen 15 30 Cl Chlorine 31 K Potassium 32 Ca Calcium 33 Fe Iron 34 Ni Nickel 35 Zn Zinc 36 Br Bromine 37 Ag Silver 38 Hg Mercury 39 Au Gold 40 I Iodine 1 - 2 Post-translational 3 Co-translational 4 Pre-translational 5 Chemical derivative 6 Artefact 7 N-linked glycosylation 8 O-linked glycosylation 9 Other glycosylation 10 Synth. pep. protect. gp. 11 Isotopic label 12 Non-standard residue 13 Multiple 14 Other 1 H Hydrogen 1.007825035 1.00794 2 H2 Deuterium 2.014101779 2.014101779 3 Li Lithium 7.016003 6.941 4 C Carbon 12 12.0107 5 C13 Carbon13 13.00335483 13.00335483 6 N Nitrogen 14.003074 14.0067 7 N15 Nitrogen15 15.00010897 15.00010897 8 O Oxygen 15.99491463 15.9994 9 O18 Oxygen18 17.9991603 17.9991603 10 F Fluorine 18.99840322 18.9984032 11 Na Sodium 22.9897677 22.98977 12 P Phosphorous 30.973762 30.973761 13 S Sulfur 31.9720707 32.065 14 Cl Chlorine 34.96885272 35.453 15 K Potassium 38.9637074 39.0983 16 Ca Calcium 39.9625906 40.078 17 Fe Iron 55.9349393 55.845 18 Ni Nickel 57.9353462 58.6934 19 Zn Zinc 63.9291448 65.409 20 Se Selenium 79.9165196 78.96 21 Br Bromine 78.9183361 79.904 22 Ag Silver 106.905092 107.8682 23 Hg Mercury 201.970617 200.59 24 Au Gold 196.966543 196.96655 25 I Iodine 126.904473 126.90447 1 1 C 10 2 1 H 15 3 1 N 2 4 1 O 2 5 1 S 1 6 2 C 13 7 2 H 18 8 2 N 3 9 2 O 2 10 2 S 1 11 2 H2 4 12 3 C 15 13 3 H 22 14 3 N 3 15 3 O 3 16 3 S 1 17 3 H2 4 18 4 C 18 19 4 H 27 20 4 N 4 21 4 O 4 22 4 S 1 23 4 H2 8 24 5 C 20 25 5 H 29 26 5 N 4 27 5 O 5 28 5 S 2 29 5 H2 8 30 6 C 22 31 6 H 29 32 6 N 4 33 6 O 5 34 6 S 2 35 6 H2 8 36 7 C 10 37 7 H 15 38 7 N 2 39 7 O 2 40 7 S 1 41 8 C 13 42 8 H 22 43 8 N 3 44 8 O 2 45 8 S 1 46 9 C 15 47 9 H 26 48 9 N 3 49 9 O 3 50 9 S 1 51 10 C 18 52 10 H 35 53 10 N 4 54 10 O 4 55 10 S 1 56 11 C 20 57 11 H 37 58 11 N 4 59 11 O 5 60 11 S 2 61 12 C 22 62 12 H 37 63 12 N 4 64 12 O 5 65 12 S 2 1 12 2 12 3 12 4 12 5 12 6 12 7 13 8 13 9 13 10 13 11 13 12 13 418 1 O 1 417 1 C 2 416 1 H 2 190 2 O -1 189 2 N 1 188 2 H 1 511 3 S 1 510 3 O 2 509 3 N 2 508 3 C 10 507 3 H 14 888 4 O 1 887 4 N 1 886 4 C 2 885 4 H 3 1146 5 O 1 1145 5 N 1 1144 5 C 1 1143 5 H 1 813 6 O 2 812 6 C 2 811 6 H 2 193 7 O 1 192 7 N -1 191 7 H -1 993 8 S 1 992 8 O 6 991 8 N 4 990 8 C 22 989 8 H 38 999 9 S 1 998 9 O 6 997 9 N 4 996 9 C 22 995 9 H2 8 994 9 H 30 170 10 S -1 169 10 O 1 168 10 C -1 167 10 H -2 400 11 S -1 399 11 C -1 398 11 H -4 2870 12 S 1 2869 12 O 5 2868 12 N 4 2867 12 C 20 2866 12 H2 8 2865 12 H 26 2864 13 S 1 2863 13 O 5 2862 13 N 4 2861 13 C 20 2860 13 H 34 407 14 C 1 406 14 H 2 225 15 O 1 224 15 C 2 223 15 H 2 210 16 O 1 209 16 C 1 1461 17 O 1 1460 17 N 1 1459 17 C 5 1458 17 H 9 205 18 O18 1 204 18 O -1 411 19 O 1 392 20 S 1 391 20 O 5 390 20 N 4 389 20 C 18 388 20 H 30 436 21 P 1 435 21 O 3 434 21 H 1 439 22 P 1 438 22 O 3 437 22 H 1 402 23 O -1 401 23 H -2 256 24 O 1 255 24 N 1 254 24 C 3 253 24 H 5 443 25 O 1 442 25 N 1 441 25 C 7 440 25 H 5 369 26 N -1 368 26 H -3 212 27 O -1 211 27 H -2 178 28 N -1 177 28 H -3 447 29 O 2 446 29 N 1 445 29 C 6 444 29 H 9 413 30 Na 1 412 30 H -1 271 31 N 1 270 31 C 7 269 31 H 7 219 32 O 2 405 33 O 1 404 33 N -1 403 33 H -1 409 34 C 1 408 34 H 2 751 35 O 1 1154 36 C 2 1153 36 H 4 1148 37 C 3 1147 37 H 6 426 38 O 2 425 38 C 1 429 39 S 1 428 39 C 1 427 39 H 2 2665 40 S 1 2664 40 O 3 448 41 Hex 1 455 42 S 2 454 42 O 1 453 42 C 8 452 42 H 12 456 43 HexNAc 1 458 44 C 15 457 44 H 24 461 45 O 1 460 45 C 14 459 45 H 26 471 46 P 1 470 46 O 5 469 46 N 1 468 46 C 8 467 46 H 8 474 47 O 1 473 47 C 16 472 47 H 30 476 48 C 20 475 48 H 32 487 49 S 1 486 49 P 1 485 49 O 6 484 49 N 2 483 49 C 11 482 49 H 20 503 50 P 2 502 50 O 15 501 50 N 9 500 50 C 27 499 50 H 31 506 51 O 5 505 51 C 51 504 51 H 96 1311 52 N 2 1310 52 C 1 1309 52 H 2 282 53 O 2 281 53 C 9 280 53 H 16 451 54 O 6 450 54 C 6 449 54 H 8 481 55 S 1 480 55 O 6 479 55 N 3 478 55 C 10 477 55 H 15 569 56 O 1 568 56 C 2 567 56 H2 3 566 56 H -1 572 57 O 1 571 57 C 2 570 57 H 2 575 58 O 1 574 58 C 3 573 58 H 4 578 59 O 1 577 59 C13 3 576 59 H 4 619 60 O 1 618 60 N 1 617 60 C 7 616 60 H 13 615 61 O 1 614 61 N 1 613 61 C 7 612 61 H2 3 611 61 H 10 624 62 O 1 623 62 N 1 622 62 C 7 621 62 H2 6 620 62 H 7 629 63 O 1 628 63 N 1 627 63 C 7 626 63 H2 9 625 63 H 4 600 64 O 3 599 64 C 4 598 64 H 4 606 65 O 3 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